生態(tài)學(xué)科于2001年經(jīng)教育部批準(zhǔn)設(shè)置生態(tài)學(xué)本科專業(yè)并招生，同年獲得生態(tài)學(xué)專業(yè)碩士學(xué)位授予權(quán)；2003年獲得生態(tài)學(xué)專業(yè)博士學(xué)位授予權(quán)，同年生態(tài)學(xué)科被批準(zhǔn)為安徽省重點(diǎn)學(xué)科；2011年獲得生態(tài)學(xué)一級學(xué)科博士學(xué)位授予權(quán)。本學(xué)科在揚(yáng)子鱷保護(hù)研究領(lǐng)域具有很高的國際關(guān)注度。研究成果多次在中央電視臺科學(xué)頻道報道。

本學(xué)科師資力量強(qiáng)，專任教師中，教授11名、副教授12名、講師5名。專任教師全部具有博士學(xué)位，其中1人獲國外博士學(xué)位，7人有海外留學(xué)經(jīng)歷。擁有講席教授1名、安徽省學(xué)術(shù)和技術(shù)帶頭人（1人）及后備人選（2人）共3名。綜合素質(zhì)良好的師資隊伍為人才培養(yǎng)奠定了基礎(chǔ)條件。
本學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)下設(shè)種群與群落生態(tài)學(xué)、保育生態(tài)學(xué)、進(jìn)化生態(tài)學(xué)、污染生態(tài)學(xué)等4個研究方向。在輪蟲種群生態(tài)學(xué)及進(jìn)化生態(tài)學(xué)、瀕危動物的遺傳多樣性與系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系、魚類群落生態(tài)學(xué)及漁業(yè)資源保護(hù)和利用、水生態(tài)毒理學(xué)及水環(huán)境監(jiān)測、污染土壤的生態(tài)修復(fù)與治理以及昆蟲群落生態(tài)學(xué)等研究領(lǐng)域具有明顯優(yōu)勢。
生態(tài)學(xué)作為安徽省重點(diǎn)學(xué)科，擁有安徽省重要生物資源保護(hù)與利用研究重點(diǎn)實驗室、安徽省高校生物環(huán)境與生態(tài)安全重點(diǎn)實驗室，擁有安徽省生物標(biāo)本資源數(shù)字化公共服務(wù)平臺、皖江城市帶退化生態(tài)系統(tǒng)的恢復(fù)與重建省級協(xié)同創(chuàng)新中心、安徽師范大學(xué)—中國科學(xué)院東湖生態(tài)站大學(xué)生校外實踐教育基地。
十二五期間，2個一級學(xué)科共主持各類科研項目90余項，累計科研經(jīng)費(fèi)2600余萬元（不包括各種平臺建設(shè)經(jīng)費(fèi)）；發(fā)表SCI(E)收錄論文200余篇；獲安徽省自然科學(xué)獎二等獎、三等獎各1項；1人獲得“全國優(yōu)秀科技工作者”稱號；1人獲得“全國模范教師”，1人獲安徽青年科技獎。1篇生態(tài)學(xué)博士學(xué)位論文獲安徽省優(yōu)秀博士學(xué)位論文，是迄今為止安徽省唯一一篇生態(tài)學(xué)科的省級優(yōu)博論文。高質(zhì)量的研究工作，擴(kuò)大了學(xué)科的學(xué)術(shù)影響，提升了服務(wù)能力，為社會做出了重要貢獻(xiàn)。