四川大學制藥工程專業(yè)設(shè)立于1998年，是全國首批招生的幾所重點院校之一，在較短的時間形成了化學制藥、生物制藥、中藥制藥以及制劑工程等專業(yè)方向齊全的制藥工程專業(yè)，采取重點本科、基地班、創(chuàng)新班以及校際聯(lián)合培養(yǎng)的多種方式。現(xiàn)有在校本科生約600人，已并逐步形成“理工相融、實踐導向、創(chuàng)新訓練”的辦學特色，2011年獲準“國家級特色專業(yè)”建設(shè)，已發(fā)展成為全國綜合院校實力最強的制藥工程專業(yè)和學科之一，并于2013年度獲準建設(shè)四川省卓越工程師教育培養(yǎng)計劃。2015年，制藥工程專業(yè)順利通過了工程教育專業(yè)認證。
目前的制藥工程專業(yè)涵蓋了藥物及制藥中間體合成工藝及設(shè)備、天然藥物技術(shù)及工程、藥物制劑工程、藥物分析及制藥過程檢測、藥物計算機輔助分子設(shè)計及過程模擬、新材料與新制劑研究與開發(fā)和生物制藥等方向。已建設(shè)成同時具有制藥工程學士、碩士、博士學位授予權(quán)、博士后流動站以及工程碩士授予權(quán)的我國少數(shù)幾所高等院校之一，在中國西部獨占鰲頭，在全國頗具影響力。
該專業(yè)現(xiàn)有在職專業(yè)教師33人，其中94%的教師具有博士或碩士學位，90%以上的教師具有不同程度的工業(yè)化或科技轉(zhuǎn)化的工程實踐經(jīng)驗。與此同時還聘請有大中型制藥企業(yè)、設(shè)計院、研究院的高級工程師、專家為兼職教師，擔任畢業(yè)教學指導、理論和實踐課程授課等教學工作。
培養(yǎng)目標：培養(yǎng)適應(yīng)21世紀現(xiàn)代醫(yī)藥工業(yè)生產(chǎn)與發(fā)展需要的畢業(yè)生。學生應(yīng)系統(tǒng)地掌握現(xiàn)代制藥工程及相關(guān)科學技術(shù)的基本理論、基本知識和基本技能，具有良好的人文素養(yǎng)和創(chuàng)新意識，能從事醫(yī)藥及相關(guān)領(lǐng)域的工藝與工程設(shè)計、技術(shù)與生產(chǎn)管理、質(zhì)量管理與控制、技術(shù)與產(chǎn)品研發(fā)、經(jīng)營管理等工作，成為所從事領(lǐng)域的專業(yè)技術(shù)和管理工作的骨干。
主干課程：計算機基礎(chǔ)、物理化學、生物化學、化工原理、生物藥理學、藥劑學、藥物化學、天然藥物化學、生物制藥技術(shù)、藥劑制劑工程、藥物分析、藥事管理與法規(guī)、化學制藥工藝學、藥物研制與開發(fā)。