信息安全系成立于2011年，擁有信息安全、網(wǎng)絡工程和網(wǎng)絡空間安全（新增）三個本科專業(yè)。信息安全專業(yè)2007年招生，是新疆第一個信息安全本科專業(yè)，同時也是自治區(qū)第二輪重點產業(yè)緊缺人才建設專業(yè)和自治區(qū)戰(zhàn)略新興專業(yè)。網(wǎng)絡工程專業(yè)于2011年招生。為響應國家加快網(wǎng)絡安全人才培養(yǎng)號召，2018年向教育申報網(wǎng)絡空間安全專業(yè)。
擁有專業(yè)教師15人，高級職稱7人，博士學位5人，45歲以下教師11人。其中，教育部高等學校信息安全教學指導委員會專家1人，自治區(qū)教學名師1人，自治區(qū)教學能手2人，寶鋼優(yōu)秀教師獎2人。擁有公安部頒發(fā)的信息安全等級保護測評師8人，注冊信息安全專業(yè)人員CISP培訓講師5人。
擁有信息安全基礎、網(wǎng)絡攻防、物聯(lián)網(wǎng)安全和網(wǎng)絡技術四個實驗室，占地面積260平方，設備總值約400萬。依托創(chuàng)新實驗室，近五年學生獲國家、自治區(qū)、校及企業(yè)大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)計劃項目20項，參加中國信息安全鐵人三項賽、全國大學生信息安全競賽等10余種學科競賽，取得省部級三等獎以上獎勵100余人次。
信息安全系已為新疆及全國畢業(yè)生共500余人，廣泛就業(yè)于政府機關、部隊、金融、能源、通信、教育，以及知名的信息安全企業(yè)和IT企業(yè)。部分畢業(yè)生被保送至武漢大學、四川大學等985高校攻讀碩士學位，畢業(yè)生升學率高達32%。
近五年主持各類教學改革項目10余項，發(fā)表教研論文20余篇，主持校級精品課程2門，獲得自治區(qū)教學成果二等獎1項。圍繞國家、自治區(qū)發(fā)展重大需求，在不良信息監(jiān)測、數(shù)據(jù)流過濾和等保測評等方面開展科學研究與社會實踐工作。近五年獲國家等各類科研項目60余項，科研經(jīng)費近千萬，獲發(fā)表論文60篇，軟件著作權40余項。